El área de Fraccionamiento se encarga de separar, conservar y distribuir los componentes sanguíneos (hematíes, plasma y plaquetas) a todos los hospitales, públicos y privados, de la Comunidad de Madrid.
Se ocupa igualmente del mantenimiento continuado de las reservas de sangre, con el nivel de seguridad requerido, así como de atender los casos cuyo tratamiento transfusional implique la disponibilidad de componentes sanguíneos poco frecuentes.